由于南非拥有丰富的铀矿资源，而以色列则拥有丰富的核科学人才，两国早在1960年代便开始了秘密的核计划合作。在两国的秘密合作中，以色列得以从南非获得大量的铀矿资源，而南非则从以色列手上拿到了丰富的核开发材料。
根据著名美国记者西摩·赫舍的报道，在船帆座卫星拍摄到闪光的当天，由两艘以色列海军船只组成的舰队正搭载着一批以色列核科学家在附近的海域游荡。这使得很多人确信，这道被卫星拍摄到的闪光正是由南非和以色列两国进行的秘密核试验所引发的!
南非政府一直极力否认本国的核武器计划与船帆座事件的关联，而且国际原子能机构也推测该国不可能在1979年11月前造出核弹。不过，对于以色列来说，拥有核武器已经不是什么秘密，1986年，一名以色列技术人员叛逃西方，爆出以色列已经拥有100枚核弹头后，举世震惊，人们这才想起当年印度洋之上那次奇怪的“双闪”，顿时幡然醒悟。
流星体撞击
1980年5月23日，由美国总统吉米·卡特所组织调查团队判定船帆座卫星没有侦测到核爆炸，而是一次小流星体撞击卫星导致的错误记录。卡特总统倾向于支持该结论，尽管国防情报局排除了这个结论，因为这样撞击的几率为千亿分之一。除了国防情报局，包括海军研究实验室和洛斯阿拉莫斯国家实验室在内的其他部门和机构亦不同意这一结论。
卫星误报
船帆座卫星6911号发射于1969年5月23日，而船帆座事件发生时卫星已经服役了十年整，且卫星一电磁脉冲传感器曾于1972年发生故障，虽然该故障已于1978修复，不过也无法排除传感器故障导致卫星误报。
