二战后殖民地国家纷纷寻求独立，卢旺达统治阶级也希望摆脱比利时的托管，实现完全的自由。 比利时不能逆势而上，但它也不想利用图西精英，为了自身利益最大化，比利时转而全力支持胡图族。 短短几年时间胡图人就翻身了，1960年比利时支持卢旺达举行大选。 结果，占人口多数的胡图族自然而然地击败了图西族，从而夺取了政权和军队。
胡图人上台后，图西人立即被清算。 大批图西族精英逃往邻国避难，而留在卢旺达的图西族则成为压迫的对象。 因此虽然胡图族和图西族的地位发生了逆转，但两个族群之间的矛盾依然存在，而且越来越尖锐。
逃离卢旺达的图西精英在乌干达建立了“卢旺达爱国阵线”。 他们多次组织军队反击卢旺达，想从胡图人手中夺回政权。 卢旺达胡图族也因政治不和、争权夺利而产生矛盾，导致胡图族统治形势不断恶化。
1973年，胡图族温和派领袖哈比亚利马纳发动政变夺取政权。 在20多年的执政生涯中，哈比亚利马纳一直在努力缓和胡图族与图西族之间的矛盾，寻求两者共存的途径。 然而胡图族的强硬派，主要是年轻人，并不买账。 他们大声宣扬两族之间的仇恨，甚至号召胡图族拿起武器，将图西族全部杀光，这为随后的卢旺达种族灭绝奠定了基础。
1994年4月6日，卢旺达总统哈比亚利马纳和布隆迪总统恩塔里亚米拉在坦桑尼亚会晤后同机飞往卢旺达。 然而这架飞机在卢旺达首都基加利附近被击落，两位总统同时遇难。
坠机当天，胡图族强硬派声称是图西人， 4月7日，胡图族士兵冲进总理府，杀死了图西族女总理和三名部长，悲剧性的卢旺达大屠杀就这样开始了。
