显微镜当中的目镜和物镜有明显区别，最主要的是两者的结构不同。目镜有两大部分组成，并且这两部分分别位于上端和下端，上方的透镜就是目透镜，主要起到是图像放大的作用。而位于下方的透镜则称为下透镜，其能够聚合光线在打到上方的透镜上。这样上方的透镜所呈现出的影像便会更亮，同时光线也会更加均匀。下透镜之下还装有其他附件。
一、物镜为透镜组合
物镜的一大特色就是其本身就是一个组合，物镜当中有许多透镜，并且经过特殊的方式组合在一起。之所以要为物镜设计一个组合，是因为单个透镜成像有很明显的缺点，其质量并不高。因此为了使透镜呈现出的图像更加清晰，质量更高，人们设计出了物镜这个透镜组。
除结构不同之外，目镜和物镜的用处也是不同的，人们常常使用目镜来观察与光学系统有关的图像。目镜常常被应用于包括望远镜在内的许多仪器当中，人们使用目镜来获取一个物体的实像，同时再将这个实像放大，以得到更加清晰和准确的物体图像。
二、目镜有标记
为了使放大效果更加明显，目镜往往会采用放大率较高，同时视场很大的镜片。采用目镜的显微镜主要靠目镜来使图像放大，因此物镜的水平直接影响该显微镜成像的水平。只有物镜的分辨率高，同时清晰程度水平高，显微镜已经所成的像才会有更高的分辨率以及水平更高的清晰度。因此在使用物镜显微镜的过程中，专家们会反复调整物镜，使其处于正常水准，由此才能得到更高质量的成像。
与物镜相比，目镜的一大特色就是有标记。在目镜上往往有关于目镜各个参数的标志，例如其放大率如何，类别如何。并且目镜虽然能够起到放大作用，但不同目镜放大的倍数是不同的，并且其材质不同，放大倍数也存在不同，学界关于目镜的放大倍数做出了一定的规定。目镜与物镜结合，物镜可以呈现清晰的图像，而目镜则捕捉物镜投射的实像，再将其进行放大。与物镜相比，目镜的作用则更加直接，那就是放大图像。值得注意的是，若通过物镜人们无法判断出一个物体的结构。那么即便目镜的放大倍数再多，人们也无法判断出该物体的结构如何。
