山羊作为几千年前最温顺的野生动物，人类早早就将其驯化，但是至今也无法找到关于山羊和绵羊的直系祖先，没有相应的确切化石证据。但是可以确定的是99%的家山羊都拥有着野山羊的基因片段，比如其中有112个片段就是高加索羱羊给予的，而105个则是它本身的基因链。
最早被驯化的野山羊学界普遍认为是来自伊朗西南部地区，但是在驯化的过程中逐渐的杂交了其他品种，因此家山羊的祖先不能说是特定的某一类，而是非常多种，据说在1万年前的新时期时代，人类就开始将其驯养，最终在世界范围内开始扩散繁殖，途中杂交了大量的当地野生品种，比如捻角山羊被认为是绒山羊的祖先，而中欧的古山羊也曾被认为是家山羊的祖先，还有北山羊等物种也都曾经存在争议。
但是目前为止并没有明确的证据能够说明山羊和绵羊的祖先具体是什么物种，只能说家山羊从野山羊驯化而来，过程中掺杂了非常多的不同分支，西北农林科技大学的团队曾经对山羊的基因进行了研究和分析，最终发现它们都拥有着一种叫做MUC6的抗病基因，而之后经过对比，发现这一基因来自于黑海附近的一种“西高加索羱羊”，能够大大的提升胃肠道抗寄生虫的效果。
而就是这种叫做MUC6的抗病基因在短短的1千年之内就传遍了全球，几乎60%以上的山羊都具有这一基因，所以家山羊的部分祖先可能与西高加索羱羊有关，但是科学家也发现家山羊基因库和野山羊基本上有99%都是相似的，但其中112个片段是属于西高加索羱羊的，而还有105个属于家山羊本身。
而家山羊在基因杂交和演化的过程中也越来越适应于与人类的共同生活，相较于野生山羊来说，家山羊的抗病性更强，毕竟从自由的野生环境转换到高度密集的易感染的人为环境是非常危险的，而想要维持个体的健康，就需要进行基因的演化。
