关于少年们的死因警方和孩子们的父母一直存在争议。由于警方在未有法医专家指导的情况下急于进行挖掘遗体破坏毁损了现场，使得不能够得到失踪相关的重要情报，受到了非议。警方过早的断定发现当时遗骸堆放、以及盖着衣服这些细节是因为孩子们在山上迷路后为了取暖，甚至认为可能是低体温造成孩子们的死亡。
但是青蛙少年失踪事件的被害者家属及住在卧龙山下的老人抗议：“平时把卧龙山当成游乐场所来回跑的孩子们，白天迷路而死亡这哪有道理?卧龙山本身与村子不远，晚上在山里能看到村里的灯光。”
最终被认定为他杀后，警方动员了2万名警力展开了大规模调查，而且还对200多件举报和情报等一一进行了确认，但仍毫无收获。
就这样在没有找到死亡原因和任何嫌疑人的情况下，时间到了2006年3月25日诉讼时效期到期。韩国杀人案的诉讼时效为15年，杀人凶手逍遥法外而大邱青蛙少年失踪事件也成为了至今没有解开的谜团。2011年，根据该事件拍成的电影，《孩子们/青蛙少年失踪事件》在韩国上映。
